בתחילת שנת 2000 התפרסם ב"מעריב" תחקיר מאת יואב יצחק, לפיו קיבל הנשיא ויצמן במשך שנים כספים מידידו המיליונר אדוארד סרוסי, ולא דיווח עליהם. מהתחקיר עלו חשדות לכאורה למעשי שוחד ועבירות מס.
המשטרה פתחה בחקירה בעניין. למרות שהיה לנשיא הראשון שנחקר על-ידי המשטרה, סירב ויצמן לעזוב את תפקידו והכחיש בתוקף שמועות כי בכוונתו להתפטר.
לאחר מספר חודשי חקירה, המליצה המשטרה לסגור את תיק החקירה. למרות שעלו חשדות לכאורה לעבירות מס, חלה על עבירות אלו התישנות. ראיות לעבירות שוחד לא נמצאו.
הפרקליטות קיבלה את המלצות המשטרה לסגור את התיק אולם פירסמה דו"ח ציבורי חמור על הנשיא. בדו"ח מתחו היועץ המשפטי לממשלה, אליקים רובינשטיין, ופרקליטת המדינה, עדנה ארבל, ביקורת חריפה על תפקוד הנשיא. "נורמות ההתנהגות המחייבות אותו - גבוהות יותר", כתבו בין השאר. ויצמן עצמו אמר כי "הפרשה הטילה עלי כתם".